生活在网络里的是《黑客帝国2》，战斗在游戏里的是《特工小子》。科学狂人和荒岛惊魂后，这回天才特工小姐弟必须面对的，是解救全世界孩子的任务和一个庞大危险疯狂的虚拟游戏……
　　在莫名其妙的失去了他的特工工作以后，“少年版007”朱尼·柯蒂斯（达利奥·萨巴拉饰）被告知他必须设法进入一个虚拟游戏的世界，他的姐姐卡门·柯蒂斯（阿历克夏·维加饰）的精神被禁锢在那里。
　　游戏的设计者是一个被成为“玩具制造商”（席维斯·史泰龙饰）的狂人，他有五个全然不同的分裂人格，出于邪恶的目的，他希望能够通过这个游戏控制全世界的孩子。为了打败他，朱尼加入了一个由全世界招募而来的孩子们组成的游戏测试小组中，进入虚拟世界接受层出不穷的挑战。朱尼面临着一系列考验：比如在炽热的火山岩浆上冲浪，和巨大的机器人与异种怪兽交战，又或者危险重重的夺命狂奔。
　　即使有曾经也是天才特工的祖父帮忙，朱尼能够成功的通过这些关卡，拯救姐姐卡门并最终打败邪恶的玩具制造商吗？答案当然是……